openBIS for Data Analytics: Navigating ELN-LIMS openBIS with Jupyter & pyBIS (openBIS Python Module)

oBIS data analytics online-011
11.07.2025
2.5 Std.
  • 11.07.2025, 09:00 - 11:30
Ende Anmeldefrist: 09.07.2025
Online-Kurs
  • Kuzyakiv,?Rostyslav
8
10
kostenlos

Dieser Kurs wird im Rahmen des Mandats von ETH Scientific IT Services angeboten, Forschende an der ETH Zürich beim Management von Forschungsdaten zu unterstützen ( siehe https://sis.id.ethz.ch/services/#research-data-management)

Behandelte Themen:

  • ELN-LIMS openBIS
  • Jupyter (Grundlagen) und pyBIS (ein openBIS-Python-Modul: https://pypi.org/project/PyBIS/)
  • Starte mit openBIS Jupyter Notebooks: Daten herunterladen/hochladen, grundlegendes Plotten und Registrierung von Projekten, Experimenten und Schritten mit pyBIS.

In diesem Kurs behandeln wir die Grundlagen der wissenschaftlichen Datenverwaltung und -analyse mit Jupyter Notebook und piBIS im ELN-LIMS openBIS-Framework sowie dem ETHZ Research Data Node.

Den Teilnehmern wird an diesem Tag ein openBIS-Testserver zur Verfügung gestellt.
Englisch
Experimentelle Wissenschaftler, die in Forschungslabors arbeiten (Master- und PhD-Studenten, Postdocs, wissenschaftliche Mitarbeiter). Der Kurs ist auch für openRDM.swiss-Kunden zug?nglich.
Dieser praxisorientierte Kurs richtet sich an fortgeschrittene Anf?nger und Programmierer auf mittlerem Niveau mit grundlegenden Python-Kenntnissen, die ihre F?higkeiten im Bereich Datenmanagement und -analyse mit Jupyter in ELN-LIMS openBIS und openBIS JupyterHUB verbessern m?chten.
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